Francesca Bonaita si diploma a diciassette anni cn il massimo dei voti e lode presso il Conservatorio G.Verdi di Milano, vincendo il Premio Pina Carmirelli quale miglior violinista dell'anno accademico. Dall'eta di tredici anni studia con Sergej Krylov e sotto la sua guida si laurea con lode, conseguendo due Master of Arts, in Music Performance (2018) e in Specialized Music Performance (2020), Soloist Diploma presso la Scuola Universitaria del Conservatorio della Svizzera Italiana a Lugano. Ammessa ai corsi di Alto Perfezionamento di Salvatore Accardo presso lo Stauffer Center for Strings di Cremona (2014-2019) e Accademia Chigiana di Siena, frequenta masterclasses con prestigiosi violinisti del panorama internazionale, quali Mihaela Martin (Festival Budapest, SchlossAkademie), Jonian Ilias Kadesha, Dmitri Chichlov, Natalia Prishepenko all’Accademia di Musica di Pinerolo, Francesca Dego, Sergey Khachatryan, Piercarlo Sacco, Atos Trio e Trio di Parma all’Accademia Perosi di Biella.